Evolutionary analysis of 3 isolates of Seneca Valley virus from a single pig farm

对来自同一猪场的3株塞内卡谷病毒分离株进行进化分析

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作者:Jianguo Dong,Dan Rao,Xin Geng,Mingrui Chen,Shuhai He,Fengchao Jiao,Li Huang,Bin Chen,Pandeng Zhao,Feng Cong

Abstract

in English, French Vesicular disease caused by Seneca Valley virus (SVV) has recently emerged throughout China and caused certain industry losses. We used immunofluorescence and western blotting to confirm that 3 new SVV strains (CH-GDSG-2018-1, CH-GDSG-2018-2, and CH-GDSG-2018-3) were from 1 pig farm. Phylogenetic analysis revealed the following: i) all 3 strains belong to USA-GBI29-2015-like clades, ii) CH-GDSG-2018-3 might have diverged from CH-GDSG-2018-1 and CH-GDSG-2018-2, and iii) CH-GDSG-2018-3 is a recombinant of the CHhb17 and HeNKF-1 strains. Virus growth curves showed that CH-GDSG-2018-3 had stronger proliferation ability in vitro. Seneca Valley virus has evolved extensively within China and this study has furthered our understanding of SVV epidemiology. La maladie vésiculeuse causée par le virus de la vallée de Seneca (SVV) est récemment apparue dans toute la Chine et a causé certaines pertes dans l’industrie. Nous avons utilisé l’immunofluorescence et l’immunobuvardage pour confirmer que trois nouvelles souches de SVV (CH-GDSG-2018-1, CH-GDSG-2018-2 et CH-GDSG-2018-3) provenaient d’un seul élevage de porcs. L’analyse phylogénétique a révélé ce qui suit : i) les trois souches appartiennent à des clades de type USA-GBI29-2015, ii) CH-GDSG-2018-3 pourrait avoir divergé de CH-GDSG-2018-1 et CH-GDSG-2018-2, et iii) CH-GDSG-2018-3 est un recombinant des souches CHhb17 et HeNKF-1. Les courbes de croissance virale ont montré que CH-GDSG-2018-3 avait une capacité de prolifération in vitro plus forte. Le virus SVV a considérablement évolué en Chine et cette étude a approfondi notre compréhension de l’épidémiologie de ce virus.(Traduit par Docteur Serge Messier).

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